Erste Haftzeit (nur Untersuchungshaft Männer)
Die ursprüngliche Haftunterbringung während der Untersuchungshaft stellt die Erste Haftzeit dar, die in drei Stationen vollzogen wird. Dies bedeutet, dass die inhaftierte Person 23 Stunden am Tag in der Zelle verbringen. Sie erlebt nur eine Stunde Unterbruch durch einen Spaziergang. Ebenfalls verlässt die Person die Zelle zu Vorführungen, bei Anwaltsbesuchen, Besuchen, zur Körperpflege oder Reinigung der Zelle. Die Mahlzeiten werden durch die geöffneten Zellentüren an den Inhaftierten abgeben. In jeder Zelle steht ein Fernsehapparat mit einigen fremdsprachigen Sendern. Die Unterbringung erfolgt in Doppelzellen (mit jeweils einem Notbett) oder Einerzellen. Die wenigen Einzelzellen ind sehr begehrt.
- Anzahl Zellenplätze: Männer 35 (plus 9 Notbetten)

Gruppenhaft (Untersuchungshaft Männer und Frauen)
Die Gruppenhaft wurde bereits bei der Projektierung des neuen Gefängnisses geplant. In der Station ist jeweils ein Gruppenraum integriert, in dem sich die Inhaftierten vormittags und nachmittags aufhalten können. Im Unterschied zur Ersten Haftzeit werden die Mahlzeiten im Aufenthaltsraum gemeinsam eingenommen.
In dieser Situation muss sich die inhaftierte Person mit ihrem Umfeld auseinandersetzen und kann sich trotzdem in ihre Zelle zurückziehen. So wohnen auf engstem Raum Menschen mit den verschiedensten Persönlichkeiten, Kulturen, Religionen und Ansichten zusammen.
- Anzahl Zellenplätze: Männer 42 (plus 12 Notbetten), Frauen 17 Plätze (plus 5 Notbetten)
Vollzug/Kurzstrafen (Männer und Frauen)
Im Aufbau zeigen diese beiden Stationen keinen Unterschied zu einer Gruppenhaftstation der Untersuchungshaft. Hier wird hingegen versucht, eine Tagesstruktur anzubieten und umzusetzen. Gemäss dem Gesetz müssen Inhaftierte im Strafvollzug einer Tätigkeit innerhalb des Gefängnisses nachgehen.
- Anzahl Zellenplätze: Männer 15 (plus 5 Notbetten), Frauen 11
AuG-Bereich (nur Frauen)
Die Unterbringung im Untersuchungsgefängis Basel-Stadt wird bei der Ausschaffungshaft (nur Frauen) in einer Gruppenhaftstation durchgeführt. (Die Ausschaffungshaft für Männer obliegt dem Ausschaffungsgefängnis Basel-Stadt beim Bässlergut.)
- Anzahl Zellenplätze: 4 (plus 3 Notbetten)